通常的热熔胶涂布机控制系统中一般控制结构与其他自动化机器相同，业已形成了相对稳定的模式，知识库由数学过程模型、辨识与估计算法、控制器运行方法和控制性能判据组成。由于热熔胶涂布机自动化系统的实时约束、任务的非线性、有限的执行器速度和范围、鲁棒性、算法的明晰性、可维护性等因素的存在，—些基本的设计要求限定了算法的执行，最为重要的是，机电过程与控制的同步设计，即系统的静态和动态性质，执行器的类型和位置，传感器的类型和位置，均要适当地设计，使全局的控制性能良好，所以在实时条件下只能用简单的算法或软件模块来完成控制任务，一些热熔胶涂布机机电一体化系统采用较低层的一般控制结构。
然而，现代数字技术的发展提供可以处理更多控制任务的条件，因而，自适应控制、学习控制，带故障诊断的监测，维护决策、其至于丰富的运动和经济的最优化控制、协调控制等控制方法均巳广泛应用，使热熔胶涂布机机电一体化系统能够以更好的性能来完成更复杂和更精确的任务。
